通过行政程序进行的协议离婚由民政部门主管。协议离婚的登记管理机关在城市是街道办事处或者市辖区、不设区的市的民政部门，在农村是乡镇、民族乡的人民政府。
1、申请。
协议离婚必须双方亲自到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请，不得委托他人代理。申请时各方应持户口证明、居民身份证明、所在单位或村、居民委员会出具的介绍信、离婚协议书、结婚证等，以便登记管理机关查明当事人身份，确定管辖权。
2、审查。
婚姻登记管理机关在受理当事人的离婚登记申请后，应当在一个月内进行审查，在审查过程中，应全面了解协议的内容，尤其是注意双方当事人请求离婚的意思表示是否真实，子女抚养夫妻一方的生活困难帮助、分割财产及债务处理等事项是否合适。
3、登记。
婚姻登记管理机关审查后，对符合离婚条件的，应予登记，发给离婚证，注销结婚证;对于不符合法定条件不予登记的，应以书面形式说明不予登记的理由，夫妻关系从当事人领取离婚证时起解除。离婚的当事人一方不按照离婚协议履行应尽义务的，另一方可以向人民法院提起民事诉讼。
4、撤销。
申请离婚的当事人弄虚作假、骗取离婚登记的，婚姻登记管理机关应当撤销离婚登记，对离婚的当事人宣布其解除婚姻关系无效并收回离婚证，并对当事人处以200元以下的罚款。如果当事人认为其符合离婚条件，可以依法申请行政复议，对复议决定不服，可以依法提起行政诉讼。
协议离婚好还是诉讼离婚好?如果从成本时间上当然协议离婚比较好。具体好处如下：
1、时间短
只要手续齐全，当事人一般当场就可以办出离婚证书;而诉讼离婚所需的时间，少则一个月，多则几个月。如果一方当事人在国外，甚至在国外下落不明，离婚所需时间更长，可能最长要两年左右的时间。根据我国《中华人民共和国民事诉讼法》(以下简称《民事诉讼法》)的审限规定，按简易程序审理的离婚案件，审限为3个月，按普通程序审理的离婚案件，一般审限为6个月。比如，在上海，一般的离婚案件，如果财产争议在500万元以下，并且没有其他重大、复杂因素，基本都适用简易程序。而对于重大或相对复杂的案件，一般适用普通程序。因此，相对诉讼离婚而言，协议离婚所需时间最短。可见，协议离婚，是最节约时间成本的离婚方式。
2、费用低
不论家里有多少财产，离婚的双方当事人一般办理离婚手续只收取10元左右的手续费就可以办结，以北京市为例，北京市离婚登记仅收取9元钱的离婚证工本费。而离婚诉讼法院是按争议财产收费的，当事人共同财产越多，法院收费越高。少则50元，多则几千、几万甚至几十万元。目前根据《人民法院诉讼费收取办法》的规定，离婚案件按财产争议额收取，如果争议财产在1万元以下，收费50元，争议财产超过1万元的部分，按争议财产1%的比例收取受理费。另外，如果案件涉及财产保全或财产价值评估，还要另行交纳保全费或评估费，又是一笔不小的开支。可见，协议离婚基本上没有经济成本，而对诉讼离婚而言，花费的经济成本要大得多的多。
3、压力小
因为协议离婚很快就可以办结，不像诉讼离婚那样需要几个月的时间，所以当事人避免了几个月的诉讼过程带来的思想压力，精神上可能受到的折磨会少一些，因为离婚手续相对隐密，来自父母和周围朋友的压力也会小一些。而诉讼离婚过程中，当事人通常要花费几个月的时间，来自双方本身、双方亲属乃至法院的压力时间较长，心理疲惫期较长，精神压力自然大得多。
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