(一)二手房合同纠纷作为民事纠纷，可以通过协商或者诉讼的方式予以处理。
所谓协商处理，就是二手房买卖合同的当事人对合同中有争议的部分进行协商，从而对原合同中规定的或者没有规定的内容进行修改、删除和增加。当事人按照协商后的内容履行各自的权利义务。
二手房买卖纠纷的协商处理，可以理解为把先前的二手房合同作废掉，然后经过协商后再签订新的合同。协商处理二手房纠纷的优点在于，减少了当事人的成本，有利于纠纷的迅速解决。
(二)二手房买卖纠纷起诉法院怎么处理
如果二手房买卖的当事人不能通过协商的方式解决二手房合同纠纷，那么，就只能向法院起诉，要求法院来处理二手房买卖纠纷。
法院处理二手房买卖纠纷的主要依据是《民法通则》和《合同法》以及二手房买卖合同。一般来说，除非存在特殊情况，比如欺诈、胁迫等，否则法院都会尊重二手房买吗合同的约定。最终，法院对二手房买卖纠纷的处理主要是以二手房合同为依据。
不过，打官司最重要的问题是证据，没有证据，口头上的主张法院都是难以支持的。我国民事诉讼实行的是谁主张谁举证的原则，也就是说，当事人自己提出一项主张，就必须同时拿出一份证据来证明，否则法院就一般不会认可这个主张。二手房买卖纠纷中最重要的证据是二手房买卖合同，当然还包括其他一些证人证言和文件等。
二手房买卖纠纷常常是因为当事人在二手房合同中对相关事项约定的不够明确和完整所导致的，一般来说，发生二手房买卖纠纷后，很多人在协商无果的情况下，最终只能向法院起诉。但是，起诉时必须要收集到充分的证据来证明自己的主张，否则法院很可能不不予认可。一般情况下，法院处理二手房买卖纠纷的依据是二手房合同，所以当事人应当十分重视二手房合同的内容。
重庆二手房合同纠纷律师提醒您，为了避免发生纠纷，也为了保证在起诉后能得到好的判决，最好能让律师对您的二手房买卖合同把把关。
本文结合二手房买卖合同纠纷的实践，总结出了以下二手房买卖合同纠纷的主要类型：
1、逾期支付房款引起的纠纷;
2、逾期交付房屋引起的纠纷;
3、逾期办理过户手续引起的纠纷;
4、要求返还定金引起的纠纷;
5、因中介行为引起的纠纷;
6、要求解除房屋买卖合同或确认房屋买卖合同无效引起的纠纷;
7、因房屋质量引起的纠纷;
8、因“黑白合同”引起的纠纷;
9、因户口迁移引起的纠纷。
第一，检查房屋的产权证和土地证，看两证是否齐全(有些房本是两证合一的);
第二，是要看清楚产权证是否被抵押和土地证上的土地使用年限的记载;
第三，检查房屋本身的质量。除了以上几点之外，还要注意房屋是否被卖房人出租;
第四，要检查房产证上的产权人姓名和卖房人的身份证上的姓名是否一致。
第五，看产权证上是否有共有人，如果有共有人，还需要共有人出具书面同意证明。即使是夫妻共有的情况，也需要另一方出具证明，以避免纠纷;
第六，对于买方来说，除了要严格按照建设委员会的二手房买卖合同格式订立合同之外，还需要将一些细节问题纳入合同内容。主要包括房屋的物业管理交接，户籍的迁移等问题。
第七，买方可以留一定的房款作为“保证金”，等买房将物业管理交接，户籍迁出之后再将房款全部交齐。
第八是对于贷款无法如约办下来的情况要尤其注意，这是导致最近一些二手房合同纠纷的主要原因。买房人可以在合同中事先约定，可以设立一个期限，如果由于客观原因到期未能办理按揭贷款，双方的解决办法。