首先，二者在股东权利的行使上是不同的。记名股票只能由股票上记载的股东行使股东权利，其他人即使合法持有该股票，也不得行使股东权利;而无记名股票，只要是合法持有该股票的人，均可以行使股东权利。
其次，二者在转让方式上不同。无记名股票的转让，以实际交付为要件，只要股东将该股票交付给受让人，就发生转让的法律效力;记名股票的转让，按照各国公司法的规定，一般都要求必须履行一定的程序，比如要求采取股票背书的形式进行转让，或者要求签署书面的股份转让合同等。同时，记名股票的转让必须办理过户手续，即要求将受让人的姓名或者名称记载于公司的股东名册中，否则受让人不得以该转让来对抗公司、行使股东权利。
再次，在具体的股东权利行使上，二者也是有所不同的。对于记名股票，公司召开股东大会或者进行分红等事项，只需要直接通知股东就可以了;而对于无记名股票，则需要以公告的方式进行通知。同时按照《公司法》有关规定，无记名股票的持有人出席股东大会的，应当于会议召开前5日至股东大会闭会时，将股票交存于公司。
1、股东权利归属于记名股东
对于记名股票来说，只有记名股东或其正式委托授权的代理人，才能行使股东权。除了记名股东以外，其他持有者(非经记名股东转让和经股份公司过户的)不具有股东资格。
2、认购股票的款项不一定一次性缴足
缴纳股款是股东基于认购股票而承担的义务，一般来说，股东应在认购时一次性缴足股款。但是，基于记名股票所确定的股份公司与记名股东之间的特定关系，有些国家也规定允许记名股东在认购股票时可以不一次性缴足股款。
3、转让相对复杂或受限制
记名股票的转让必须依据法律和公司章程规定的程序进行，而且要服从规定的转让条件。一般来说，记名股票的转让都必须由股份公司将受让人的姓名或名称、住所记载于公司的股东名册，办理股票过户登记手续，这样受让人才能取得股东的资格和权利。而且，为了维护股份公司和其他股东的利益，法律对于记名股票的转让有时会规定一定的限制条件，如有的国家规定记名股票只能转让给特定的人。
4便于挂失，相对安全
记名股票与记名股东的关系是特定的，因此，万一股票遗失，记名股东的资格和权利并不消失，并可依据法定程序向股份公司挂失，要求公司补发新的股票。
我国《公司法》对此的具体规定是：记名股票被盗、遗失或者灭失，股东可以依照《民事诉讼法》规定的公示催告程序，请求人民法院宣告该股票失效。依照公示催告程序，人民法院宣告该股票失效后，股东可以向公司申请补发股票。
无记名股股票所有权的特点是必须具体地占有股票本身，持有无记名股票的股东需要经常向公司提示股票，留心股东大会的消息。无记名股票的好处在于发行手续简单，易于购买和转让，不足之处在于无记名股票的转让，由股东将该股票交付给受让人后即发生转让的效力。
1、股东权利归属股票的持有人
确认不记名股票的股东资格不以特定的姓名记载为根据，而是以占有的事实为根据。因此，持有该股票的人就是股东，就可以行使股东权利。也因为这一点，为了防止假冒、舞弊等行为，不记名股票的印制特别精细，其印刷技术、颜色、纸张、水印、号码等均须符合严格的标准。
2、认购股票时要求缴足股款
不记名股票上不记载股东姓名，若允许股东缴付部分股款即发给股票，以后实际上将无法催缴末缴付的股款，故认购者必须缴足股款后才能领取股票。
3、转让相对简便
与记名股票相比，不记名股票的转让较为简单与方便，原持有者只要向受让人交付股票便发生转让的法律效力，受让人取得股东资格不需要办理过户手续。
4、安全性较差
因为没有记载股东姓名的法律依据，所以，不记名股票一旦遗失，原股票持有者便丧失了股东权利，且无法挂失。 公司对股东情况难以控制，可能导致经营风险较大。对社会公众发行的股票，可以为记名股票，也可以为无记名股票