报复陷害罪的侦查机关由检察院负责。报复陷害罪的主体是特殊主体，即国家机关工作人员。
法律依据
《中华人民共和国刑法》第二百五十四条
国家机关工作人员滥用职权、假公济私，对控告人、申诉人、批评人、举报人实行报复陷害的，处二年以下有期徒刑或者拘役;情节严重的，处二年以上七年以下有期徒刑。
报复陷害罪与诬告陷害罪的区别主要体现在以下几个方面：
1、客体要件不同：报复陷害罪侵犯的是公民的控告权、申诉权、批评监督权与举报权等民主权利，而诬告陷害罪侵犯的是公民的人身权利和司法机关的正常活动。
2、对象不同：报复陷害罪的对象是控告人、申诉人、批评人与举报人，而诬告陷害罪的对象则是一切公民。
3、主体不同：报复陷害罪的主体是国家机关工作人员，而诬告陷害罪的主体则是一般主体。
4、行为表现不同：报复陷害罪表现为滥用职权、假公济私，对控告人、申诉人、批评人、举报人实行报复陷害的行为，而诬告陷害罪则表现为捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究。
5、目的不同：报复陷害罪的目的是为了报复陷害他人，而诬告陷害罪的目的是为了使他人受到刑事追究。
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