1. 乡镇人民政府调解
乡镇人民政府在农村地区承担着土地纠纷的调解和处理工作。由于其工作人员长期在当地工作，对当地的土地情况十分熟悉，因此能够依据相关的法律法规，公平公正地进行调解。当农村邻居之间发生土地纠纷时，首先应尝试向乡镇人民政府反映情况，寻求调解解决。
2. 县级以上人民政府自然资源主管部门处理
如果通过乡镇人民政府的调解无法达成和解，或者纠纷涉及的问题较为复杂，需要更专业的处理，那么当事人可以向县级以上人民政府自然资源主管部门申请处理。该部门主要负责土地资源的管理和监督工作，拥有专业的土地法律知识和执法权力，能够对纠纷进行深入的调查，准确地认定责任归属，并依法进行处理。
3. 村集体组织调解
除了上述两个部门外，村集体组织也可以作为调解农村邻居土地纠纷的一个重要力量。村集体组织会依据相关的法律法规以及村里的村规民约，站在公平公正的角度去调解纠纷，努力促使双方能够和解。
农村邻居土地纠纷是可以起诉的。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，当事人认为自己的合法权益受到侵害时，可以向人民法院提起诉讼。对于农村邻居土地纠纷而言，如果双方无法通过调解等方式解决，且一方认为自己的土地权益受到了侵害，那么就可以依法向人民法院提起诉讼。
在起诉前，当事人需要做好充分的准备工作。要收集好与纠纷相关的证据材料，如土地权属证明、土地使用合同、现场照片或视频等。这些证据将有助于法院准确地认定事实，从而做出公正的裁决。其次，要了解相关的法律法规和诉讼程序，确保自己的诉讼行为合法合规。
在诉讼过程中，法院会根据法律规定和具体的案件情况，进行全面的审查和判断。如果一方的行为确实构成了对另一方土地权益的侵犯，那么法院将责令侵权方承担相应的法律责任，如恢复原状、赔偿损失等。同时，法院也会根据案件情况，对双方进行调解，努力促使双方达成和解。
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百二十二条 起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;
(二)有明确的被告;
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。