合伙企业与有限公司的核心差异源于法律性质的根本不同。
根据《合伙企业法》第二条，合伙企业分为普通合伙与有限合伙两种形式：普通合伙企业的全体合伙人对企业债务承担无限连带责任，即当企业资产不足以清偿债务时，债权人可追索至合伙人个人财产;有限合伙企业中，普通合伙人仍承担无限责任，而有限合伙人仅以出资额为限承担有限责任。
这种责任设计使得合伙企业更适用于风险共担、利益共享的紧密型合作场景，如律师事务所、会计师事务所等。
相比之下，有限公司作为独立法人，依据《公司法》第三条，股东以其认缴的出资额为限对公司债务承担有限责任。
即使公司破产，股东个人财产亦不受牵连。这种责任隔离机制降低了投资风险，成为吸引外部资本、实现规模化经营的主流选择。
在管理架构上，合伙企业遵循“人合性”原则，合伙人共同参与决策，决策效率较高但易因意见分歧影响运营;有限公司则通过股东会、董事会、监事会等“三会一层”架构实现“资合性”管理，决策程序更规范但灵活性相对较低。
税收政策差异显著：合伙企业实行“先分后税”，合伙人按“个体工商户生产经营所得”缴纳个人所得税;有限公司需缴纳企业所得税，股东分红时再缴纳个人所得税，存在双重征税问题。
注册合伙企业需严格遵循《合伙企业登记管理办法》规定的程序。
第一步为名称预先核准，申请人需向企业登记机关提交《企业名称预先核准申请书》及全体合伙人身份证明，核准后取得《企业名称预先核准通知书》。
名称中需标明“普通合伙”“特殊普通合伙”或“有限合伙”字样，以明确企业类型。
第二步是制定合伙协议并申请设立登记。
合伙协议作为核心文件，需载明企业名称、经营场所、合伙人出资方式及数额、利润分配与亏损分担规则等关键条款。
根据《合伙企业法》第十八条，协议需经全体合伙人签字盖章后生效，修改或补充需一致同意。
申请设立时，需提交登记申请书、合伙协议、全体合伙人身份证明、出资确认书等材料;若经营范围涉及前置审批项目(如教育培训、医疗器械销售)，还需提交相关批准文件。
企业登记机关自受理申请之日起20日内作出是否登记的决定。
核准登记后，申请人领取营业执照，企业成立日期以营业执照签发日为准。
后续需完成刻制公章、财务章等印章，凭营业执照到公安机关指定地点办理;税务登记环节，需确定税种、税率并领取发票;最后选择银行开设基本账户，完成资金收付系统搭建。