1. 行为主体不同
帮助伪造证据罪的主体是一般主体，即年满十六周岁且具有刑事责任能力的自然人，无论其职业身份如何，只要实施帮助伪造证据行为即可构成。伪证罪的主体是特殊主体，仅限于刑事诉讼中的证人、鉴定人、记录人、翻译人，这些人员因参与诉讼活动具有特定职责，其伪证行为对案件影响更大。
2. 发生阶段不同
帮助伪造证据罪可发生在刑事、民事、行政诉讼等各类诉讼活动前、中、后各个阶段，只要行为人实施了帮助伪造证据行为且情节严重即可。伪证罪仅发生在刑事诉讼过程中，从立案侦查到审判执行整个阶段，证人等特定主体作伪证才会构成此罪。
3. 行为对象不同
帮助伪造证据罪的行为对象是各类诉讼中的证据，包括物证、书证、证人证言等多种证据形式。伪证罪的行为对象仅限于刑事诉讼中的证人证言、鉴定意见、记录内容、翻译内容，范围相对较窄。
4. 犯罪目的不同
帮助伪造证据罪行为人目的多样，可能是为帮助当事人逃避法律制裁、获取非法利益等。伪证罪行为人目的通常是为了使无罪的人受追诉、有罪的人不受追诉或影响案件公正审判，直接干扰刑事诉讼正常进行。
情节严重认定。帮助伪造证据罪立案需达到情节严重程度。情节严重包括帮助伪造关键证据，对案件定罪量刑有重大影响;多次帮助伪造证据;帮助伪造证据导致司法机关多次开庭、延长审限，严重干扰诉讼活动正常进行;造成严重社会影响或引发群体性事件等。
证据要求。立案需有证据证明行为人实施了帮助伪造证据行为。证据形式多样，如证人证言证实行为人参与伪造证据过程，物证如伪造的证据材料本身，书证如相关聊天记录、书面协议等证明帮助行为存在。证据需达到确实、充分程度，能排除合理怀疑。
主体身份确认。需确认行为人是具有刑事责任能力的自然人。通过户籍证明、身份证等材料核实年龄，通过精神状态鉴定确认是否具有辨认和控制自己行为能力。只有具备主体身份，才可能构成此罪。
主观故意证明。要证明行为人主观上是故意帮助伪造证据。通过行为人言行、行为方式等推断其主观意图。如行为人积极为当事人出谋划策伪造证据，主动提供伪造工具等，可认定其具有故意。
司法解释对帮助伪造证据罪情节严重进行细化。如帮助伪造证据导致案件错误裁判，造成他人财产重大损失或人身严重伤害;帮助伪造证据行为引发媒体广泛关注，造成恶劣社会影响;帮助伪造证据涉及重大案件，如危害国家安全、恐怖活动犯罪等案件。
司法解释明确共同犯罪中帮助伪造证据罪认定。行为人与当事人共谋伪造证据，分工合作实施帮助行为，按共同犯罪处理。根据行为人在共同犯罪中作用大小，确定主犯、从犯，分别承担相应刑事责任。
司法解释区分帮助伪造证据罪与其他罪名界限。如与包庇罪区别，包庇罪是向司法机关作虚假证明掩盖犯罪，帮助伪造证据罪是帮助当事人伪造证据;与诈骗罪区别，诈骗罪是以非法占有为目的虚构事实骗取财物，帮助伪造证据罪主要干扰司法活动。
司法解释规定量刑情节。对于自首、立功、认罪认罚等情节，依法从宽处理。对于累犯、惯犯等情节，依法从重处罚。量刑时综合考虑犯罪事实、性质、情节和社会危害程度。