两个户口本对应一处宅基地，确权时通常登记为共同共有或按份共有，具体取决于家庭内部协议及历史使用情况。父亲已有宅基地，儿子能否再申请，核心在于是否完成合法分户且符合“一户一宅”政策。如果儿子已婚并独立生活，且原宅基地无法满足居住需求，经批准可分户申请新地。