处理运输纠纷，货主与运输公司应优先协商或申请行业调解，不成则向法院起诉或依约仲裁。货物运输纠纷主要由交通运输主管部门行政监管，民事赔偿则由人民法院裁决。遇到纠纷直接报警通常无法解决民事赔偿问题，除非涉及货物被盗、抢劫或司机诈骗等刑事犯罪。