医院违规修改病历将面临法律严惩，直接导致在医疗损害责任纠纷中承担全部或主要赔偿责任。法律明确规定，一旦查实病历存在伪造、篡改或销毁情形，法院将直接推定医疗机构有过错，无需患者再证明医疗行为与损害后果的因果关系。