九十年代拥有房产证但缺失土地证，通常属于历史遗留问题，并非绝对无法解决。只要房屋建设符合当时的规划与审批要求，通过补办手续或依据地方政策，一般可以完善产权。对于没有房产证的九十年代房屋，只要不是违法建筑，通常会被认定为合法面积，尤其是在面临征收拆迁时，其权益会受到法律保护。