破坏耕地罪立案标准，非法占用基本农田五亩以上或基本农田以外耕地十亩以上，造成种植条件严重毁坏即构成犯罪。恢复原状需承担土壤改良、平整土地等费用，赔偿包括农作物损失、地力损失。处理方式涵盖行政处罚、刑事追责及民事赔偿，严重破坏者将面临五年以下有期徒刑及罚金。