我应以个人承担无限责任还是以公司法人承担有限责任？五年有没有过诉讼时效？

因为你注销公司时,没有通过正常的破产程序,也没把对方列为债权人进行清偿,根据公司法的有关规定,公司股东会被推定为来意逃债，公司注销后就由股东承担连带赔偿责任。这是有法律依据的。