《巴黎公约》只承认国、使用国商标主管机关认可的该国。国务院“三定方案”明确把认定驰名商标的职权赋予国家工商总局商标局。我国商标局认定的196个驰名商标已得到国际社会的承认。但《知识产权协议》已明确要缔约方对知识产权的确权行为实行全面司法审查。因此，人民法院也应是驰名商标的合法认定机构。当然，人民法院和商标局在驰名商标的认定方式、认定程序和认定效力上应有所区别。
在对驰名商标的认定上，两个机构应遵循统一的认定标准。驰名商标的认定应从消费者数量、地域范围、使用年限、商标价值这四个方面，客观地把握和衡量商标的驰名度、市场占有率、商品或服务的质量，在权威民意机构问卷调查、量化评估的基础上，征询有关部门和专家的意见，最终作出公正的认定。在驰名商标的认定效力上，应废除《驰名商标认定和管理暂行规定》中的3年时间限制，赋予第三人对驰名商标的撤销申请权，赋予认定机构对驰名商标的撤销权。