在申请资格认定时须提交以下证明文件：
可以从事招标代理业务的营业执照；
有关业务人员数量的证明资料和中级、中级以上专业人员及其药学专业人员情况的证明资料；
从事药品招标代理活动所用房产证明和相关设备、设施目录等情况资料；
从事药品招标代理所需相应资金的财务证明；
专家库名单及专家遴选方法；
国家药品监督管理局要求具备的其他证明资料。
对经过资格认定的，由省、自治区、直辖市药品监督管理部门发给《药品招标代理机构资格证书》。凭该证书向当地工商行政管理部门办理相应的业务增项手续。
经过资格认定并获资格证书后，可从事药品招标代理业务。
未取得资格证书的招标代理机构不得代理药品招标业务。
药品招标代理机构在承办药品招标代理业务时，应出示其资格证书。