通常，股东的股权转让收益为个人的合法所得，应当依法缴纳个人所得税。
国家税务总局最新下达的《关于加强股权转让所得征收个人所得税管理的通知》中规定，股权交易各方在签订股权转让协议并完成股权转让交易以后至企业变更股权登记之前，负有纳税义务或代扣代缴义务的转让方或受让方，应到主管税务机关办理纳税(扣缴)申报，并持税务机关开具的股权转让所得缴纳个人所得税完税凭证或免税、不征税证明，到工商行政管理部门办理登记手续。
如果虽已签订股权转让协议，但未完成股权转让交易的，企业在向工商行政管理部门申请股权变更登记时，并向主管税务机关申报。
另外，个人股东股权转让所得个人所得税，以发生股权变更企业所在地地税机关为主管税务机关。纳税人或扣缴义务人应到主管税务机关办理纳税申报和税款入库手续。主管税务机关应按照《》和《税收征收管理法》的规定，获取个人股权转让信息，对股权转让涉税事项进行管理、评估和检查，并对其中涉及的税收违法行为依法进行处罚。除应依法缴纳个人所得税外，在涉及股票转让时，应当依照法律的相关规定，缴纳印花税及其他税费。