医疗机构承担赔偿责任的前提是其在诊疗活动中存在过错。患者在诊疗活动中受到损害，若医疗机构或者其医务人员有过错，才由医疗机构承担赔偿责任。
法律还明确规定了推定医疗机构有过错的几种情形，包括违反法律、行政法规、规章以及其他有关诊疗规范的规定，隐匿或者拒绝提供与纠纷有关的病历资料，以及遗失、伪造、篡改或者违法销毁病历资料等，但患者不配合治疗并未列入其中。
在患者不配合治疗导致损害的情况下，医疗机构不承担赔偿责任。但医疗机构及其医务人员仍应尽到必要的告知义务，向患者说明病情和医疗措施，以及可能存在的医疗风险和替代医疗方案等。
法律依据
《中华人民共和国民法典》
第一千二百一十八条 患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
第一千二百一十九条 医务人员在诊疗活动中应当向患者说明病情和医疗措施。需要实施手术、特殊检查、特殊治疗的，医务人员应当及时向患者具体说明医疗风险、替代医疗方案等情况，并取得其明确同意;不能或者不宜向患者说明的，应当向患者的近亲属说明，并取得其明确同意。
医务人员未尽到前款义务，造成患者损害的，医疗机构应当承担赔偿责任。
·医疗事故的行为人必须有诊疗护理工作中的过失。
·必须是发生在诊疗护理工作中，也包括为此服务的后勤和管理。
·给病员造成危害的结果，必须符合法律规定，即“死亡、残废、组织器官损伤导致功能障碍的”，不及此程度，不能认定为医疗事故。
·危害行为和危害结果之间，必须有直接的因果关系，否则不能认定为医疗事故。
·医疗事故的行为人，必须是经过考核和卫生行政机关批准或承认，取得相应资格的各级各类卫生技术人员。因诊疗护理工作乃是群体性的活动，有时构成医疗事故的行为人，也可以是从事医疗管理、后勤服务等工作人员。
责任划分为：
完全责任：医疗事故损害后果完全由医疗过失行为造成;
主要责任：医疗事故损害后果主要由医疗过失行为造成，其他因素起次要作用;
次要责任：医疗事故损害后果主要由其他因素造成，医疗过失行为起次要作用;
轻微责任：医疗事故损害后果绝大部分由其他因素造成，医疗过失行为起轻微作用。
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