纳税人已按预售面积、预售房款缴纳契税，但办理房产证时，发现实测面积与预售面积有误差，导致房款发生变化，致使纳税人多缴税款的，可以申请退税。依据的是税收征管法第五十一条：纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴纳的税款。