你好，登记在谁的名下，登记部门是不会过问的，登记在谁名下与出资没有关系。如何保护自己应有的权益，建议在房屋登记前咨询一下律师，让律师给你一个好的建议。如果你有不明白的，可以咨询律师，山东威海律师王家花 13561874680 qq：280640997 欢迎免费法律咨询。