聚众扰乱社会秩序罪的立案标准有以下两点。第一、行为人有聚众扰乱社会秩序的行为，是构成本罪的关键。第二、聚众扰乱社会秩序，必须是情节严重，致使工作、生产、营业和教学、科研无法进行，造成严重损失，方能构成本罪。