我们公司有一个员工，在早上上班时，在商场外围墙内，上班所在的楼外，被电动车撞伤，（肇事者系餐厅员工，餐厅是商场承包给个人的）腿骨折，尾椎骨骨折，他们现在私下达成合解，肇事者赔偿我们公司员工5000元，再不承担其它责任。现在我们公司要怎么弄，在他休假期间是否还要发放工资