要看具体协议规定。支付培训费的前提是，签有服务期协议，而且单位的确出资到第三方的专业培训机构给你进行了培训。通俗的讲，就是单位要能提供出培训发票。
用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以约定违约金。就是说双方协商后，如果员工违反服务期约定的，需要支付给公司违约金。

具体扣多少，看培训协议签订的合同里的规定，如果合同里没有明确说明违约责任具体赔偿方案，一般公司可能要求全额退还。