公司注销了，员工可以申请劳动仲裁。劳动仲裁是劳动争议当事人向人民法院提起诉讼的必经程序，劳动仲裁是解决劳动争议的有效手段，因此，员工在劳动仲裁中可以申请劳动仲裁。
需要注意的是，公司注销后，员工需要尽快与公司沟通，并要求公司出具解除劳动合同的证明，以便员工可以顺利申请劳动仲裁。
法律依据
《劳动人事争议仲裁办案规则》第六条
发生争议的用人单位未办理营业执照、被吊销营业执照、营业执照到期继续经营、被责令关闭、被撤销以及用人单位解散、歇业，不能承担相关责任的，应当将用人单位和其出资人、开办单位或者主管部门作为共同当事人。
《中华人民共和国仲裁法》第二十一条
当事人申请仲裁应当符合下列条件：
(一)有仲裁协议;
(二)有具体的仲裁请求和事实、理由;
(三)属于仲裁委员会的受理范围。
申请劳动仲裁的流程如下：
1、提交申请书：当事人向劳动争议仲裁委员会申请仲裁时应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。
2、仲裁受理：仲裁委员会应当自收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的决定。
3、开庭审理：仲裁庭应当于开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人;无正当理由，当事人不到庭的，仲裁庭可以进行缺席审理。
4、仲裁调解：仲裁庭处理劳动争议应当先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。
5、仲裁裁决：仲裁庭裁决劳动争议案件时，应当自劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经劳动争议仲裁委员会主任批准，可以延期并书面通知当事人，但是延长期限不得超过十五日。逾期未作出仲裁裁决的，当事人可以就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。
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