代位赔偿是否影响次年保费主要看在事故中是否有责。无责情况下申请代位赔偿，通常不影响保费浮动。代位赔偿有严格的时间限制，保险公司向责任方追偿的诉讼时效为三年，自保险事故发生之日起算。保险公司赔付后，会依法自动取得向责任方追偿的权利，并主动启动追偿程序。