医疗保险基金是以法定或约定的方式，由社会保险经办机构根据不同的标准向参保单位和个人征集的医疗保险费，做为参保人基本医疗保障的经济基础。保险关系一般是以法定的方式建立起来的，也可以约定的方式建立。在保险关系中，一方为保险经办机构，一方为参保人。参保人享受相应的医疗保险待遇，同时，按法律或合同条款规定，参保单位和参保人有义务向保险机构缴纳一定数量的医疗保险费。医疗保险基金是由无数个参保单位和个人缴纳的医疗保险费汇集而成的。
医疗保险基金是由保险机构组织管理的，用于偿付参保人基本医疗费用的经济保障。保险机构是医疗保险基金的组织管理者，并执行医疗费用的偿付职能。医疗保险基金用于偿付医疗费用，以参保人为特定对象，依照医疗保险偿付办法，偿付符合医疗保险规定范围内的医疗费用。
医疗保险基金是一种货币形态的后备基金。医疗保险基金的筹集、医疗费用的偿付都采用货币形式。