公司股东转让股权涉及的税种主要分为个人所得税、企业所得税和印花税，不同身份的股东对应的缴税种类和计税规则存在明显差异，自然人股东与法人股东的税务处理口径完全不同。
自然人股东转让股权需要缴纳个人所得税，依据《中华人民共和国个人所得税法》第二条第八项规定，财产转让所得应当缴纳个人所得税，同时依据《股权转让所得个人所得税管理办法(试行)》第四条规定，个人转让股权以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按财产转让所得缴纳个人所得税，适用税率为百分之二十。
法人股东转让股权需要缴纳企业所得税，依据《中华人民共和国企业所得税法》第六条规定，企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入为收入总额，包括转让财产收入，股权转让所得需并入企业年度应纳税所得额，按照法定税率计算缴纳企业所得税。
股权转让行为还需要缴纳印花税，依据《中华人民共和国印花税法》第五条第一项规定，应税产权转移书据的计税依据为产权转移书据所列金额，股权转让书据属于产权转移书据范畴，转让方和受让方均需按照规定税率缴纳印花税，计税基数为股权转让协议载明的转让价款。
非上市公司股权转让不属于增值税征税范围，无需缴纳增值税，整个股权转让环节的税费缴纳需以真实交易为基础，按照公平交易价格核算，不得通过违规操作逃避纳税义务。
公司股东变更是否需要交税核心取决于变更背后是否存在股权有偿转让的经济行为，单纯的股东名称更正无对价流转的变更无需缴税，存在股权转移且取得相关收益的变更必须依法缴税。
股东变更本质是股权权属的转移，大部分股东变更场景源于股权转让行为，只要发生股权有偿转让且产生应税所得，就必须履行纳税义务，不存在股东变更天然免税的情形。如果股东变更是基于继承赠与等无偿方式且符合法定正当理由的，无需缴纳个人所得税或企业所得税，但印花税仍需按照相关规定缴纳。
依据《中华人民共和国印花税法》相关规定，只要签订股权转让相关书据，就属于印花税的征税范围。
如果股东变更是伴随股权有偿转让开展的，转让方取得所得的，自然人股东需按财产转让所得缴纳个税，法人股东需将转让所得计入应税收入缴纳企业所得税，受让方作为扣缴义务人需依法履行代扣代缴义务，公司作为被投资主体需配合做好税务申报相关工作。
税务机关会对股东变更的交易真实性和计税依据进行核查，如果申报的转让价格明显偏低且无正当理由，税务机关有权核定股权转让收入并追缴相应税款，股东变更完成后需及时办理税务备案和申报手续，确保变更流程合规。
综上所述，股权转让和股东变更的涉税问题关乎交易合规，大家务必区分主体类型和交易性质，足额申报缴纳税费。遇到复杂的股权流转场景，建议结合专业税务和法律意见处理，避免因涉税问题承担法律责任。