舅舅有案底一般不会影响外甥考公务员。根据公务员政审规定：直系血亲中或对本人有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的属于政审不合格，不能录取的。录用考核的内容为德、能、勤、绩四个方面。我国不实行连作制度，因此可以考公务员。