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招投标过程中有部分材料因为佐证不全面，被认定作废，是否可以申诉

评标委员会的评标依据只能是投标单位在投标截止时间前递交的投标文件以及招标文件规定的评标办法。除此以外的所有东西都不能作为评标依据，如果你确实是因为投标文件的制作问题少放了证明材料，没有任何办法补救。
就算你通过了资格审查，也仅仅能说明你们公司在通过资格审查的那天那个时间是有投标资格，但是到评标那天，你的投标文件没办法证明你公司的投标资格，废标是肯定的。