我家宝宝刚出生就羊水感染，第三天出现黄疸，后面做脑部CT，和抽血有出现巨细胞病毒感染呈阳性，先天性，我们家里小孩爸爸老家安徽滁州，当地有新农村合作医疗，上班的地方也有医疗保险，小孩子妈妈就今年忘了交新农村合作医疗，请问，小孩子啊住院的费用，能报销吗？什么样的流程？