一些当事人由于种种原因而耽误了申诉时效，仲裁委员会应当区别情况，分别处理：
1、对无正当理由超过申诉时效的劳动争议，当事人就丧失了申诉的权利，仲裁委员会不予受理。
2、申诉时效届满还要查明有无申诉中止的情况。如果扣除中止时间后不超过申诉时效的，仲裁委员会应依法受理。
3、《企业劳动争议处理条例》第23条规定：当事人因不可抗力或者其他正当理由超过规定的申请仲裁时效的，仲裁委员会应当受理。“不可抗力”是指不能预见、不能避免并不能克服的情况。
例如，因地震、水灾、火灾等现象产生的或者因战争或其他类似的军事行动等社会现象而产生的情况。“其他正当理由”则范围很宽，例如当事人不知道有仲裁委员会而向其他部门申诉延误时效或者生病，或者童工的法定代理人未确定等等，至于“理由”是否正当，则应由仲裁委员会认定。
超过仲裁时效当事人还能主张权利吗能。超过仲裁时效只是表明了劳动者失去了“胜裁权”，不能通过仲裁的程序维护自己的权益，但是还有“胜诉权”——即便超过仲裁的法定时效，劳动者也能就该劳动争议向人民法院提起诉讼。而通过诉讼程序，一般劳动权利的诉讼时效就延长至两年。
劳动争议仲裁时效中的特殊规定申请劳动仲裁的一般时效为一年。但是，在有些情况下，一年的时效期间还不能保护劳动者的合法权益。如在有的行业，尤其是建筑业，拖欠工资问题比较突出，工人的劳动报酬很多到年底才结算;还有些劳动者为了维持劳动关系，在劳动关系存续期间对用人单位拖欠劳动报酬的行为不敢主张权利。如果都适用一年的仲裁期间，不利于保护他们的合法权益。因此本条第四款规定：“劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制。”对于劳动者与用人单位的劳动关系已经终止的情况，则没有维系劳动关系这样的顾虑，因此本条第四款作出了“劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出”的规定。