根据我国《土地管理法》的规定，宅基地纠纷的解决办法，主要有三种：
1、协商解决：
《土地管理法》第16条第1款规定：”土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。“据此规定，公民之间发生的宅基地纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
2、行政解决：
《土地管理法》第16条第2款规定：”个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。“该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
3、司法解决：
《土地管理法》第16条第3款规定：”当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。
4、此外，宅基地纠纷还可以通过人民调解来解决。
宅基地使用权属于物权的一种，诉讼时效一般适用于债权，理论及司法实践上，普遍认为对物权不适用诉讼时效的规定。宅基地侵权属于侵犯物权的行为，应该不受诉讼时效的限制，不存在超过诉讼时效的问题。
根据《土地管理法》第十六条第三款规定，当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。
这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只与按照《土地管理法》第十六条和第五十三条的规定，先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。否则，人民法院不予受理。
但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民法院起诉。
由上可知，宅基地纠纷不适用诉讼时效，当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。
1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请;
2、双方当事人出示举证的材料和依据;
3、工作人员现场调查材料和取证;
4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书;
5、调解为达成协议的，或者调解书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。
在面对宅基地拆迁补偿纠纷的时候，先进行调解，不能调解成功再进行起诉。