一般因为“阴阳合同”中的“阳合同”因不体现当事人的真实意思而不发生效力，而“阴合同”是当事人的真实意思表示而认定为有效合同，“阴合同”只要内容合法，同样受到法律保护。但是，如果利用“阴阳合同”实施违法行为，或者以合法的形式掩盖违法的目的，则不仅伪装的“阳合同”无效，被伪装的“阴合同”也因内容违法而无效。因此，对使用"阴阳合同"要慎之又慎。
实践中，如果双方签订“阴阳合同”的行为严重违反了中国税收管理规定，有关部门查实后，如果属于一般偷税行为，行政机关有权予以罚款、拘留等行政处罚;如果偷税数额较大、次数较多，则可能构成犯罪。
因此“阴阳合同”是否有效本质上取决于合同内容是否有符合合同法规定的合同无效的几种情形，如果合同内容违反《刑法》相关规定，当事人还将受到相应的刑事处罚。
一是关于阳合同的效力，基于其没有体现当事人的真实意思，依据《民法总则》第143条规定，应认定为无效合同。
二是关于阴合同的效力，因体现了当事人的真实意思表示，只要内容合法，不违反法律、行政法规强制性规定，应认定有效合同，受法律保护。
三是如果利用阴阳合同实施违法行为，或者以合法的形式掩盖违法的目的，则不仅伪装的阳合同无效，被伪装的阴合同也因内容违法而无效。
四是在土地房屋交易过程、建设工程施工过程中存在许多阴阳合同，因其违反税收规定，税收部门查实后，如果属于一般偷税行为，给予罚款、拘留等行政处罚;如果偷税数额较大、次数较多，则可能构成刑事犯罪。
1、对于差价较小的，一般认定合同有效。
2、对于差价太大，一般会认定无效。
3、对于卖方不想卖，主张中介与买方恶意串通以低价过户损害其利益的，一般认定合同有效但过户价格条款无效。
4、对于买方不想买而主张卖方避税，或者签现售后只想以现售合同上的低价买，一般认定合同有效但过户价格条款无效。
5、对于双方仍想交易但过户时一方主张以真实价过户，另一方拒绝的，会调解，调解不成则认定合同不成立。
6、没签过户确认书，现售价变少的，视为双方意思变更，现售合同有效。