1、协商
按照法律和商业惯例，一旦出现商业纠纷，双方应首先在自愿、平等的基础上进行友好协商，寻求解决的可能性。双方既有商业联系，对纠纷产生的原因应是心中有数，假如双方从合作的愿望出发并持客观公正的态度，通过坦诚、细致的磋商，纠纷是不难解决的。要害是双方协商不成，而应依据双方的协议，遵照有关的法规和通常的商业惯例，本着互谅互让、实事求是的精神，提出公平合理的解决方案，即可达成和解协议。这是大多数人的首选方式。当然，这种和解协议的内容必须合法，不损害国家、社会、第三人利益。自行协商解决纠纷，不受时间、地点和法定程序的限制，能维持双方的商业关系，消除隔阂或误解，增进双方的情谊。
2、调解
经过协商不能达成协议时，双方可申请业务主管部门(如工程造价管理协会等)出面进行调解。业务主管部门是依法负有对日常商业活动的指导、管理、监督之责，他们比较认识本行业的业务，比较全面的把握情况，由其出面调解，既轻易做纠纷双方的思想工作，又能准确运用法规，提出合理和中肯的解决方案。此外，主管部门还可以运用法律和制度答应的方式，给纠纷双方以必要的帮助、照顾和支持。
假如协商一致，纠纷双方也可以共同委托所信赖的第三者(个人或团体)出面调解。由第三者进行调解，有较高的灵活性、中立性、专业性和权威性，比较超脱和公正，不致因某种利害关系而偏袒一方或损害另一方的利益，调解专家充分听取双方的意见，耐心细致说服双方，以自己专业和人格上的感召力促使双方互相让步而达成和解。
3、仲裁
假如纠纷双方不愿通过协商和调解，或者协商、调解不成时，就只能在仲裁和诉讼两种方式中作一选择。仲裁作为解决商业纠纷的重要方式，具有与法院诉讼同等的法律地位和强制执行效力。
4、诉讼
毫无疑问，诉讼是解决商业纠纷最严肃的手段，同时也是最终的手段，在万不得已之下才予以采用。目前投诉立案难，程序烦琐、耗时漫长，诉讼费、律师费高，不可猜测的因素(如法官素质、行政干预、地方保护等)多、风险大。随着司法制度的不断健全和完善，“打官司”将变得越来越方便、越来越公正。
1、准确选择被告，选择发包人、承担连带责任保证担保方式的任何当事人;
2、证据资料必须充分，有准确合理的诉讼请求;
3、提交起诉状，法院作出是否受理的决定;
4、法院受理后，进行开庭审理;
5、经过法庭辩论、法庭调解等程序后，依法作出判决。
1、证明双方当事人身份的证据材料。个人的是双方身份证资料，公司的是双方工商登记资料，如营业执照或工商查询资料。
2、证明建设工程合同关系成立的证据材料。如合同，会议纪要，来往邮件、信函，现场工程签证单等等一切相关的证据材料。
3、证明建设工程合同履行情况的证据材料。
(1)工程预、决算报告;
(2)支付工程款的付(收)款凭证;
(3)当事人对工程量、工程质量共同确认的证据，如工程验收、结算凭证，质检报告等。
4、提交其它诉讼相关的证据资料。如向法院提交主张赔偿金额的计算方法及计算清单等。