1.适用主体不同
立案调查：
通常由行政机关(如市场监管部门、税务机关、环保部门等)或纪检监察机关主导，针对行政违法行为或违纪行为展开。例如：
市场监管部门对涉嫌虚假宣传的企业立案调查;
纪检监察机关对公职人员涉嫌违纪的线索立案调查。
立案侦查：
由公安机关、国家安全机关、人民检察院(自侦案件)等司法机关主导，针对刑事犯罪行为展开。例如：
公安机关对盗窃、诈骗等刑事案件立案侦查;
检察院对司法工作人员利用职权实施的犯罪(如刑讯逼供)立案侦查。
2.法律依据不同
立案调查：
依据《行政处罚法》《行政机关公务员处分条例》《中国共产党纪律处分条例》等行政或党内法规。例如：
市场监管部门依据《反不正当竞争法》调查商业贿赂;
纪检监察机关依据《中国共产党纪律检查机关监督执纪工作规则》调查违纪行为。
立案侦查：
依据《刑事诉讼法》及相关司法解释。例如：
公安机关依据《刑法》和《刑事诉讼法》侦查故意伤害案;
检察院依据《刑事诉讼法》第19条侦查司法工作人员渎职犯罪。
3.适用范围不同
立案调查：
针对行政违法行为或违纪行为，尚未达到刑事犯罪标准。例如：
企业超范围经营、偷税漏税(未构成逃税罪);
公职人员违反工作纪律(如迟到早退、滥用职权但情节轻微)。
立案侦查：
针对刑事犯罪行为，需追究刑事责任。例如：
故意杀人、抢劫、贪污受贿(数额较大或情节严重);
危害国家安全、恐怖活动等严重犯罪。
4.调查手段与权限不同
立案调查：
手段相对温和，以行政检查、询问、调取资料为主，一般不涉及强制措施。例如：
市场监管部门可要求企业提供账目、合同等文件;
纪检监察机关可与涉案人员谈话、调取个人事项报告。
立案侦查：
手段更严格，可依法采取强制措施(如拘留、逮捕、搜查、扣押等)。例如：
公安机关可对犯罪嫌疑人采取刑事拘留;
检察院可对涉案财产进行查封、冻结。
立案调查本身不直接导致逮捕，只有案件转入刑事侦查阶段，且符合法定条件时，才可能实施逮捕。逮捕是刑事强制措施中最严厉的一种，必须经过严格审批，不能仅因立案调查就推定必然发生。
逮捕的前提是有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚，且采取取保候审不足以防止社会危险性。这些条件需同时满足，缺一不可。时间上没有统一规定，快则数日，慢则数月，完全取决于证据收集进度与风险评估结果。
对于现行犯或重大嫌疑分子，公安机关可在拘留后三日内提请批捕，特殊情况可延长一至四日;流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可延长至三十日。检察院应在七日内作出是否批准决定。
若案件复杂、证据链尚未闭合，即使已立案侦查，也可能长期处于取保候审或监视居住状态，不会立即逮捕。司法实践强调比例原则，强制措施必须与罪行严重程度相适应，避免过度干预公民人身自由。
整个过程中，当事人及其律师有权申请变更强制措施，提出无罪或罪轻意见。办案机关必须认真听取并记录在案。任何超期羁押或不当逮捕都将承担相应法律责任，接受监督机关审查与纠正。
总的来说立案调查由行政或监察机关启动，针对违法违纪行为;立案侦查由公安或检察机关进行，针对犯罪行为。逮捕需在侦查阶段，满足证据、刑期与社会危险性三要件，无固定时间，依案情而定。
《刑事诉讼法》第八十一条：对有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚的犯罪嫌疑人、被告人，采取取保候审尚不足以防止发生社会危险性的，应当予以逮捕。