档案引起的劳动纠纷由于性质特殊，劳动者要维护自己的合法权益比较困难。如何才能维护自己的权利呢?
1、劳动关系解除及时转移档案。根据国家有关档案转移的规定，在解除劳动关系后，单位必须在一个月内将该员工的档案转移到所在的街道、新的工作单位。因此当我们结束了前一个工作时，应当关心自己的档案是否及时转移到位，防止在调换工作中档案的丢失。
2、档案材料与事实不符，可要求单位认定并修改。如果发现单位在自己档案里塞进“黑货”侵犯了自己的就业等合法权利时，必须注重搜集足够的证据，并通过法律维护自己的合法权益。
3、不要让档案成为“死档”。要知道自己的档案保管在什么地方，其中特别要注意是委托人才服务机构保管的，必须保存好档案保管的证明，及时缴纳费用，不要让自己的档案成为“死档”。
4、处分材料入档须经本人认定。根据《流动人员档案管理规定》，档案中“收集的材料，必须经过认真的鉴别。需经单位盖章或本人签字的，签字盖章后方能归入档案”的规定，单位放入档案的材料，特别是对劳动者处理、处分的材料要求经本人签字认定。