鉴定由专家鉴定组组长主持，并按照以下程序进行：
(一)双方当事人在规定的时间内分别陈述意见和理由。陈述顺序先患方，后医疗机构;
(二)专家鉴定组成员根据需要可以提问，当事人应当如实回答。必要时，可以对患者进行现场医学检查;
(三)双方当事人退场;
(四)专家鉴定组对双方当事人提供的书面材料、陈述及答辩等进行讨论;
(五)经合议，根据半数以上专家鉴定组成员的一致意见形成鉴定结论。专家鉴定组成员在鉴定结论上签名。专家鉴定组成员对鉴定结论的不同意见，应当予以注明。
根据《医疗事故处理条例》第20-21条规定，医疗事故鉴定在设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县(市)地方医学会进行首次医疗事故技术鉴定，这是第一级医疗事故鉴定。如果对首次医疗事故鉴定结论不服的，可以向省、自治区、直辖市医学会，提出再次鉴定的申请，由省级医学会负责再次组织鉴定工作。这就是第二级医疗事故鉴定。另外我国《医疗事故处理条例》还规定了中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作。这是我国的第三级医疗事故鉴定。但中华医学会接受医疗事故鉴定必须符合一定条件：第一、是不服市县级医疗事故鉴定和省级医疗事故鉴定的鉴定结论;第二、中华医学会接受的鉴定案件，只能够是病历疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗纠纷案件。上面是医疗事故鉴定的鉴定机构选择问题，但如果是做医疗过错鉴定就不能选择医学会进行鉴定，必须选择司法鉴定进行鉴定机构，这一点是需要大家分清的。
法律依据：
《医疗事故处理条例》第二十条
卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定;医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。
《医疗事故处理条例》第二十一条
设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县(市)地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作。
必要时，中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作
委托医学会进行医疗事故技术鉴定，应当按规定缴纳鉴定费。若双方当事人共同委托医疗事故技术鉴定的，由双方当事人协商预先缴纳鉴定费。卫生行政部门移交进行医疗事故技术鉴定的，由提出医疗事故争议处理的当事人预先缴纳鉴定费。经鉴定属于医疗事故的，鉴定费由医疗机构支付;经鉴定不属于医疗事故的，鉴定费由提出医疗事故争议处理申请的当事人支付。
县级以上地方卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告后，对需要移交医学会进行医疗事故技术鉴定的，鉴定费由医疗机构支付。
重新鉴定时不得收取鉴定费。
具体的收费标准是，参加鉴定的医学专家在7人以上(含7人)的，按首次(市级)鉴定2200元/例次，(省级)鉴定3200元/例次收取;专家在7人以下的，按首次(市级)鉴定1700元/例次，(省级)鉴定2200元/例次收龋医疗事故争议当事人在收到医疗事故技术鉴定受理通知书后，如遇以下三种情况应按要求缴纳鉴定费：双方当事人共同委托鉴定的，由双方协商缴纳预缴费;卫生行政部门移交进行的鉴定，由提出医疗事故争议处理的当事人缴纳预缴费;经鉴定属于医疗事故的，由医疗机构支付鉴定费，不属于医疗事故的，鉴定费由提出争议处理的申请人支付