对没有经过有关部门审批擅自建房的行为，人民政府土地行政管理部门一经发现，坚决依法律程序处理，人民法院受案后也必将依法处理。依据以下规定处理：
《中华人民共和国土地管理法》
第七十七条 未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款;对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分;构成犯罪的，依法追究刑事责任。
超过批准的数量占用土地，多占的土地以非法占用土地论处。
第七十八条 农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。
超过省、自治区、直辖市规定的标准，多占的土地以非法占用土地论处。
《中华人民共和国土地管理法》第七十五条规定：“违反本法规定，占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等按照职责责令限期改正或者治理，可以并处罚款;构成犯罪的，依法追究刑事责任。”
当事人可以选择向当地县级以上人民政府的自然资源主管部门或农业农村主管部门邮寄针对非法占用耕地行为的《查处申请书》，请求主管部门依法做出处理。
当事人还可以选择中华人民共和国国土资源部开通的12336违法举报电话号码，对违法用地情况、违反土地资源管理的情况进行举报监督。
若遇到主管部门查处不作为的情形，还可以考虑通过行政复议、行政诉讼等途径进一步维权。
1、非法占用基本农田5亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地10亩以上会被判刑。
2、违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
3、违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的，依照刑法第三百四十二条的规定，以非法占用耕地罪定罪，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金：
(1)非法占用耕地“数量较大”，是非法占用基本农田5亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地10亩以上;
(2)非法占用耕地“造成耕地大量毁坏”是行为人非法占用耕地建窑、建坟、建房、挖沙、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他非农业建设，造成基本农田5亩以上或者基本农田以外的耕地10亩以上种植条件严重毁坏或者严重污染。
4、法律依据：《刑法》
第三百四十二条 【非法占用农用地罪】违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。