对于有明显涂改的借款合同是否仍然有效，这主要取决于涂改的部分是否得到了双方当事人的认同。如果双方都认同涂改后的内容，那么这份合同仍然具有法律效力。然而，如果一方擅自涂改合同，而对方并不认同，那么涂改的部分将被视为无效。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第五百四十三条
当事人协商一致，可以变更合同。
《中华人民共和国民法典》第五百四十四条
当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
借款合同无效的情形主要有以下几种：
1、借贷一方或双方的主体不合格。
2、一方以欺诈、胁迫的手段订立借贷合同，并且损害了国家利益。
3、借贷双方恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益。
4、以合法形式掩盖非法目的，如借款给别人去赌博或贩毒的。如果贷款人明知借款用途是非法活动而提供借款的，该借款合同无效，双方还将受民事制裁。
5、损害社会公共利益。
6、违反法律、行政法规的强制性规定。
7、套取金融机构贷款转贷。
8、以向其他营利法人借贷、向本单位职工集资，或者以向公众非法吸收存款等方式取得的资金转贷。
9、未依法取得放贷资格的出借人，以营利为目的向社会不特定对象提供借款。
10、出借人事先知道或者应当知道借款人借款用于违法犯罪活动仍然提供借款。
11、违反法律、行政法规强制性规定。
12、违背公序良俗。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
(一)行为人具有相应的民事行为能力;
(二)意思表示真实;
(三)不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
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