处理以旷工为由的辞退纠纷，核心是先认定用人单位的辞退行为是否合法。再根据合法性判断后续处理方式，相关权利主张和处理流程均有明确的法律依据支撑。
首先要明确辞退合法性的认定标准，这是处理纠纷的基础。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。以旷工为由辞退员工，就需满足该条款的核心要件。
具体而言，用人单位需证明三项关键事实：
一、规章制度中明确规定了旷工的认定标准和严重违反的情形，比如旷工达到一定天数即可辞退。
二、该规章制度经过民主程序制定，并且已向劳动者公示或告知，确保劳动者知晓相关规定。
三、有充分证据证明劳动者存在旷工事实，比如考勤记录工作交接凭证等。
如果用人单位无法证明上述任意一项事实，辞退行为就可能被认定为违法。根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条规定，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算。不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市自治区人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
其次是纠纷的具体处理途径，双方可根据实际情况选择协商调解仲裁或诉讼的方式解决。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四条规定，发生劳动争议，劳动者可以与用人单位协商，也可以请工会或者第三方共同与用人单位协商，达成和解协议。
协商是最便捷的解决方式，双方可就是否恢复劳动关系赔偿金额等事宜达成一致。如果协商不成，根据该法第五条规定，当事人不愿协商协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解。
不愿调解调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
劳动者申请劳动仲裁时，需注意仲裁时效的要求。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
申请仲裁时需提交书面仲裁申请，并附具相关证据材料，比如劳动合同辞退通知书考勤记录规章制度公示证明等。
仲裁委员会将根据双方提交的证据和法律规定，对辞退行为的合法性作出认定，并依法裁决相应的法律责任。如果用人单位辞退合法，仲裁委员会将驳回劳动者的相关诉求。如果辞退违法，将支持劳动者恢复劳动关系或支付赔偿金的合理主张。
用人单位在处理此类纠纷时，应当积极配合仲裁或诉讼程序，如实提交相关证据，证明自身辞退行为的合法性。
如果确实存在程序瑕疵或事实认定错误，应及时与劳动者协商弥补，避免承担更重的法律责任。
处理旷工辞退纠纷的核心是认定辞退合法性。双方可优先协商解决，协商不成可通过调解仲裁诉讼途径处理。劳动者要注意时效维权，用人单位需确保辞退程序和事实认定合法。遵循法律规定处理纠纷，才能更好维护双方合法权益，促进劳动关系和谐稳定。