船员与用人单位发生劳资纠纷，应首先明确纠纷性质。如属劳动合同争议，可申请劳动仲裁;如涉及船舶优先权或海事赔偿，则由海事法院专属管辖。船员工资纠纷既可通过劳动监察投诉、调解、仲裁解决，也可在符合法定条件下直接向海事法院起诉。