合作双方可基于各自诉求相互起诉，法律允许当事人通过诉讼维护权益。凭借有效合作协议可主张违约责任或侵权责任，协议内容直接影响诉讼请求成立与否。私人合伙协议具有法律效力，合伙人可依据协议约定或法律规定主张权利，但需注意协议条款合法性及诉讼时效限制。