首次提请审议的证券法修订草案曾规定，证券交易所对申请股票、公司债券上市交易进行审核，对不再具备上市条件的公司股票、公司债券，决定暂停上市或者终止上市。对此规定，存在两种意见：
一种意见认为，证券交易所隶属证监会，其审核上市申请、决定股票暂停上市、终止上市，都属于行政行为，当事人不服的，有权申请行政复议和提起行政诉讼;另一种意见认为，国际上证券交易所都是会员制的自律机构，按照其制定的上市规则接受上市申请，或者决定暂停上市、终止上市，都属于自律行为，当事人不服的，只能按照民事关系处理。
证券交易所作为证券市场的组织者，其依据法定上市条件和交易所上市规则对证券上市申请进行审核，属于自律管理，经审核同意上市的，证券交易所应当与上市申请人签订上市协议，通过上市协议规范双方的权利义务，形成一种民事法律关系。
据此，修订草案修改规定：“申请证券上市交易，应当向证券交易所提出申请，由证券交易所依法审核同意，并由双方签订上市协议。”