首先需要有确定的事实。在这一前提下具体的程序如下。
1.确认应尽赔偿义务的机关
具体看是什么行政机关或者机关的工作人员对赔偿请求人造成了损害。
2.提出赔偿申请
根据赔偿请求人的需求，向赔偿义务机关提出申请。申请书中应载明受害人的各项详细信息，赔偿的具体要求，事实根据和理由，具体的申请年月日。
3.等待赔偿决定
一般赔偿义务机关需要在收到申请之日两个月内做出是否进行赔偿。无论赔偿与否，都需要进行回复，赔偿会在十日后将赔偿决定书送达，不赔偿需要书面通知赔偿请求人并说明理由。
4.提起诉讼
对赔偿义务机关决定不服的，可以在收到决定起三个月内向人民法院提起诉讼。
赔偿义务机关逾期不作出决定的也可在期限满之日起三个月内向人民法院提起诉讼。
法律依据
《中华人民共和国国家赔偿法》
总则 第二条 国家机关和国家机关工作人员行使职权，有本法规定的侵犯公民、法人和其他组织合法权益的情形，造成损害的，受害人有依照本法取得国家赔偿的权利。
本法规定的赔偿义务机关，应当依照本法及时履行赔偿义务。
第二十二条 赔偿义务机关有本法第十七条、第十八条规定情形之一的，应当给予赔偿。
赔偿请求人要求赔偿，应当先向赔偿义务机关提出。
赔偿请求人提出赔偿请求，适用本法第十一条、第十二条的规定。
第二十三条 赔偿义务机关应当自收到申请之日起两个月内，作出是否赔偿的决定。赔偿义务机关作出赔偿决定，应当充分听取赔偿请求人的意见，并可以与赔偿请求人就赔偿方式、赔偿项目和赔偿数额依照本法第四章的规定进行协商。
赔偿义务机关决定赔偿的，应当制作赔偿决定书，并自作出决定之日起十日内送达赔偿请求人。
赔偿义务机关决定不予赔偿的，应当自作出决定之日起十日内书面通知赔偿请求人，并说明不予赔偿的理由。
申请国家赔偿是行政诉讼。
在行政诉讼中有着很多不同的领域。针对当事人向司法部门提处国家赔偿申请是较为独特的一个诉讼分支，这个行为旨在纠正并补偿国家机关及其工作人员在行使职权时有可能对公民、法人或者其他组织的合法权益造成损害，是我国行政诉讼中不可或缺的一部分。
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