根据《中华人民共和国民法典》第三百一十一条及相关司法解释，下列情形不适用善意取得制度。
第一，转让合同无效或被撤销的，因缺乏合法基础，不得主张善意取得。合同效力瑕疵直接阻断物权变动。
第二，标的物属于禁止或限制流通的动产，如毒品、枪支、文物等，因其交易本身违法，第三人无论是否善意，均不能取得所有权。此类物品不受市场交易规则保护。
第三，占有脱离物原则上不适用善意取得。包括盗赃物、遗失物、漂流物、埋藏物等非基于原权利人意思而丧失占有的财产。《中华人民共和国民法典》第三百一十二条规定，所有权人有权追回遗失物;如通过拍卖或经营者购得，可请求返还但应支付费用。
第四，须经登记才能转让的特殊动产，如船舶、航空器、机动车，如果未完成登记过户，即使交付，善意第三人亦不能取得完整物权对抗效力。登记是此类财产善意取得的必要条件。
第五，被依法查封、扣押的财产，因处于司法强制措施之下，任何处分行为均属无效，第三人不得以善意取得对抗执行法院。
第六，受让人存在重大过失，如交易价格明显不合理、交易场所异常、未查验权属凭证等，将被推定为非善意，排除善意取得适用。
善意取得的首要要件是处分人无处分权。即其并非所有权人，也未获授权，却以自己名义处分他人财产。如系有权处分，则直接发生物权变动，无需援引善意取得制度。
第二要件为受让人受让时出于善意。所谓善意，指不知道且不应当知道处分人无处分权。根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉物权编的解释(一)》第十四条，善意推定成立，由主张恶意的一方承担举证责任。
第三要件是受让人无重大过失。即使不知情，如未尽合理注意义务，如未查询不动产登记簿、接受明显低价转让等，仍可能被认定存在重大过失，从而否定善意。
第四要件是已完成法定公示。动产须完成交付，包括现实交付、简易交付或指示交付;不动产须完成登记。占有改定不发生善意取得效力，因其未实现物权公示目的。
第五要件为有偿取得。赠与、继承、遗赠等无偿取得方式，不适用善意取得。法律仅保护支付合理对价的交易安全。
一旦善意取得成立，法律后果明确：受让人依法取得该不动产或动产的所有权，原权利人丧失物权。原权利人仅能向无权处分人主张侵权责任、违约责任或不当得利返还，不得向善意第三人追索。
对于遗失物等占有脱离物，虽原则上不适用善意取得，但《中华人民共和国民法典》第三百一十二条设有限制性例外。如通过拍卖或具有经营资格的经营者购得，原权利人请求返还需支付受让人所付费用，体现对交易安全的部分兼顾。