最直接的后果是丧失“从宽”的量刑优惠。认罪认罚从宽制度的核心在于鼓励嫌疑人如实供述、接受处罚，以此换取司法机关在量刑上的让步。如果不签字，意味着放弃了这一法定从宽情节，法院在量刑时不会考虑这一减让因素，最终判处的刑期通常会比签署具结书建议的刑期要重。
检察机关提出的量刑建议将不再对法院具有强约束力。在认罪认罚案件中，法院一般应当采纳检察院的量刑建议。一旦嫌疑人拒绝签字，检察院将不再提出确定的量刑建议，或者提出一个较重的建议。法院在审理时，将完全依据庭审调查认定的事实和情节进行裁量，不再受此前协商结果的束缚，判决结果的不确定性随之增加。
诉讼程序可能会变得更加繁琐和漫长。认罪认罚案件通常适用速裁程序或简易程序，审理速度快。如果不签字，案件往往转为普通程序审理，需要开庭举证、质证、辩论，环节增多，耗时拉长。这不仅增加了司法成本，也让嫌疑人处于羁押状态的时间可能相应延长，心理压力增大。
辩护策略需要重新调整。签署具结书通常意味着对指控事实无异议，辩护重点在于争取更轻的量刑。如果不签字，辩护人可以做无罪辩护或罪轻辩护，对证据的合法性、真实性提出质疑。这虽然增加了翻案或减轻罪责的可能性，但也要求有扎实的证据支持，否则可能因态度不好而被酌情从重考虑。
不影响案件的正常推进和定罪。不签字并不代表案件就会停滞或撤销。只要检察机关认为犯罪事实清楚、证据确实充分，依然会向法院提起公诉。法院依然会依法开庭审理并作出判决。签字与否只是影响量刑幅度和程序快慢，不改变定罪的基本逻辑，切勿误以为不签字就能逃避法律制裁。
法院将坚持“以事实为根据，以法律为准绳”的原则进行独立审判。法官不会仅仅因为被告人没签认罪认罚书就加重处罚，也不会因为签了就无原则轻判。判决书将严格依据庭审中经过质证的证据来认定犯罪事实，如果证据链完整，即便被告人零口供或拒绝认罪，法院依然可以定罪判刑。
量刑时将不再适用从宽条款。法院在确定基准刑后，会考量各种从轻、减轻情节。由于缺乏认罪认罚这一重要情节，被告人的最终刑期往往会高于同类案件中签署了具结书的被告人。特别是在事实清楚、证据确凿的案件中，拒不认罪被视为悔罪态度不佳，可能在自由裁量权范围内被酌情从重。
对于证据存在瑕疵或争议的案件，不签字可能带来转机。如果控方证据不够扎实，被告人拒绝认罪认罚，迫使案件进入普通程序进行充分质证，辩护人有机会通过排除非法证据、指出逻辑漏洞等方式，促使法院作出证据不足、指控罪名不成立或改变定性的判决。这种情况下，不签字是维护合法权益的必要手段。
法院会对被告人的辩解进行实质审查。如果不签字是因为对事实有异议，法院会重点审查异议是否成立。如果异议合理且查证属实，法院会依法采纳，甚至可能改变指控事实。但如果异议明显无理取闹，旨在拖延诉讼或逃避责任，法院在判决时会予以负面评价，这在一定程度上会影响量刑的轻重。
判决结果具有终局性和权威性。无论是否签署认罪认罚书，法院作出的生效判决都必须执行。如果不签字导致一审判决较重，被告人仍可上诉，但二审维持原判的概率较大，除非有新证据或一审程序违法。因此，是否签字需建立在对自己案情和法律后果的清晰认知之上，盲目拒绝并非明智之举。
案件移交法院的时间主要受法定办案期限限制，与是否签署认罪认罚书无直接因果关系。侦查机关侦查终结后移送审查起诉，检察机关一般在一个月内作出决定，重大复杂案件可延长半个月。无论嫌疑人是否签字，检察机关都必须在法定期限内完成审查，要么提起公诉，要么作出不起诉决定。
不签字可能会导致审查起诉阶段的时间用满。检察官在办理认罪认罚案件时，为了促成签署，可能会花费时间与嫌疑人及其律师沟通协商。如果嫌疑人明确拒绝，检察官则需要更多时间仔细审核证据，确保在不依赖口供的情况下证据链依然完整，这可能使得审查起诉期限接近法定的一个半月上限，随后立即移送法院。
对于适用简易程序或速裁程序的案件，如果因不签字而转为普通程序，检察机关在移送法院前可能需要补充一些程序性材料，但这通常不会造成大幅延误。法律对各个诉讼阶段的期限有严格规定，办案机关不得无故拖延。因此，不签字最多只会让案件在审查起诉阶段多停留几天到十几天，不会无限期搁置。
如果案件本身疑难复杂，需要退回补充侦查，那么移交法院的时间会显著延长。退补每次一个月，最多两次。这种情况通常是因为证据不足，与是否认罪认罚关系不大，但有时嫌疑人拒不认罪会暴露出证据链条的薄弱环节，促使检察官决定退补。
总体而言，从立案到移送法院，顺利的案件通常在三四个月左右，复杂的可达半年以上。不签认罪认罚书不会成为阻碍案件移送的“拦路虎”，司法机关会依法按时推进程序。