指标没完成扣工资是否合法，不能一概而论，核心取决于用人单位的扣除行为是否符合法律规定和双方约定，合法的扣除需满足明确的约定条件和法定限制，违法扣除则需承担相应的法律责任。
《中华人民共和国劳动法》第四十七条规定，用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。这赋予了用人单位一定的工资分配自主权，允许用人单位将业绩指标与工资挂钩，在劳动者未完成指标时合理扣除部分工资。
《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了业绩指标及未完成指标的工资扣除标准，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，扣除后的工资不低于当地最低工资标准，那么指标没完成扣工资的行为是合法的。
如果双方未在劳动合同中约定，且用人单位无明确、合法的规章制度规定业绩扣底薪标准，用人单位擅自以指标未完成为由克扣工资，就属于违法行为。
同时，扣除比例必须严格遵守法律规定，每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。如当地最低工资标准为2000元，劳动者当月工资3000元，未完成指标最多可扣除600元，扣除后工资2400元，不得低于2000元，超过该比例或低于最低工资标准的扣除行为均违法。
未完成业绩扣底薪的合法性与扣工资存在本质区别，底薪作为劳动者的基本劳动报酬，受法律严格保护，用人单位不得随意以未完成业绩为由扣除底薪，仅在符合特定条件的情况下，才能对底薪进行合理扣除。
《中华人民共和国劳动法》第四十八条规定，国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。底薪作为劳动者正常提供劳动后的基本报酬，其数额不得低于当地最低工资标准，这是法律的强制性规定。
如果用人单位与劳动者约定的底薪高于当地最低工资标准，且在劳动合同或合法规章制度中明确约定，未完成业绩时可从底薪中扣除部分金额，但扣除后底薪剩余部分仍不低于当地最低工资标准，同时扣除标准合理，那么该扣除行为合法。
如果双方未约定，或者扣除后底薪低于当地最低工资标准，无论业绩完成情况如何，扣底薪的行为均违法。
需要明确的是，底薪与绩效工资不同，绩效工资可根据业绩完成情况合理浮动和扣除，但底薪是保障劳动者基本生活的固定报酬，用人单位不得将底薪与业绩完全挂钩，更不能以未完成业绩为由全额扣除底薪。
即使劳动者未完成业绩，用人单位也需支付不低于当地最低工资标准的底薪。
如果用人单位违法扣除底薪，劳动者可向劳动行政部门投诉，劳动行政部门会责令用人单位限期补足克扣的工资，逾期不补足的，用人单位需按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金，比如克扣底薪1000元，劳动者可要求用人单位补足1000元，并额外支付500元至1000元的赔偿金。
综上所述，指标没完成扣工资需符合约定和法定条件，扣除比例和剩余工资需符合规定才合法。未完成业绩扣底薪受限严格，扣除后不得低于当地最低工资标准，违法扣除需补足工资并支付赔偿金。劳动者要明确自身权益，遭遇违法扣薪可依法维权。